در حالی که سورنا ستاری، معاون علمی و فناوری ریاست جمهوری، گفته است بنیاد ملی نخبگان برای تأمین مالی به بن‌بست رسیده و دولت نمی‌تواند ریسک‌پذیر باشد، فراصندوق ستارگان با همکاری و مشارکت ستاد اجرایی فرمان امام ،معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری، دانشگاه آزاد و سازمان بورس و اوراق بهادار، با هدف تامین مالی برای توسعه فعالیت‌های استارت‌اپ‌ها تأسیس شده است.
حمیدرضا امیری‌نیا، مشاور ستاد اجرایی فرمان امام با اشاره به سرمایه‌گذاری ۶۵۰ میلیارد تومانی برای تاسیس این فراصندوق، برای توسعه فعالیت استارت‌اپ‌ها گفته است در راه‌اندازی این فراصندوق، نهادهایی مانند مخابرات، همراه اول، کمیته امداد امام خمینی، آستان قدس رضوی، سازمان اقتصادی کوثر، سازمان بنیاد مستضعفان و سازمان تبلیغات اسلامی نیز مشارکت داشته‌اند.
گفته می‌شود برخی از حوزه‌های سرمایه‌گذاری این صندوق، فناوری‌های هایتک، فناوری‌های مالی، تجارت الکترونیک، سخت‌افزاری، فناوری اطلاعات و ارتباطات و سلامت است.ستاد اجرایی در این فراصندوق پنجاه میلیارد تومان سرمایه‌گذاری کرده و گفته شده است که ده سرمایه‌گذار این فراصندوق هرکدام ده درصد سرمایه‌ی اولین این صندوق را تامین خواهند کرد. ستاد اجرایی فرمان امام یکی از نهادهای اصلی تاثیرگذار در فضای اقتصاد ایران است که با وجود در اختیار داشتن منابع کلان اقتصادی، نه در اقتصاد رسمی دولتی حضور دارد و نه از سازوکارهای اقتصادی پیروی می‌کند و حتی در لیست مالیاتی کشور قرار ندارد. در شرایط فعلی بحران اقتصادی در ایران، بسیاری از کارشناسان بر ضرورت به اشتراک گذاشته شدن منابع اقتصادی ستاد در بودجه رسمی دولت تاکید دارند و اظهار می‌دارند که حضور منابع اقتصادی ستاد اجرایی می‌تواند به عنوان یک منبع اقتصادی در فرایندهای اقتصادی کشور به کار گرفته شود.
گرچه مبلغ اختصاص یافته توسط ستاد اجرایی برای توسعه فعالیت‌های استارتاپی که با حمایت معاونت علمی ریاست جمهوری انجام می‌شود مبلغ چندان قابل توجهی نیست اما برخی معتقدتد که این اقدام ممکن است طلیعه مشارکت بیشتر ستاد اجرایی در فعالیت‌های جاری کشور باشد.
اما در عین حال برخی نیز نسبت به این مشارکت مالی ستاد اجرایی چندان خوشبین نیستند و اعتقاد دارند سرمایه‌گذاری ستاد اجرایی در توسعه فعالیت‌های استارتاپی ممکن است به منظور وجهه قانونی بخشیدن به حمایت از آن دسته از استارت آپ‌های ایران باشد که هدف از توسعه‌ی آنها تقویت فعالیت‌های نظارتی و امنیتی جمهوری اسلامی باشد
