در واکنش به اقدام شورای نگهبان در خصوص رد گسترده‌ی تمامی کاندیداها و زمینه‌سازی برای انتخاب بدون رقیب ابراهیم رئیسی به عنوان رئیس جمهور که صدای اعتراض بسیاری را بلند کرده است، حسن روحانی رئیس جمهور ایران با اشاره به ارسال نامه‌ای در اعتراض به این امر به آیتالله خامنه‌ای، روز چهارشنبه اعلام کرد در خصوص نحوه تایید صلاحیت کاندیداها نامه‌ای به رهبری نوشته و خواستار مداخله او در این موضوع شده است
حسن روحانی در بخشی از اظهاراتش با اشاره به اینکه انتخابات ریاست جمهوری مسأله بسیار مهمی است، انتخابات را نماد آزادی و آگاهی مردم دانست و تاکید کرد مردم باید با آزادی و آگاهی کامل پای صندوق آرا بیایند. وی همچنین ملاک تشخیص را مردم دانست.
حسن روحانی در بخش دیگری از اظهاراتش با اشاره به اینکه رییس‌جمهور باید مردم ایران را در مذاکرات خارجی نمایندگی کند، اظهار داشت اگر حضور مردم در انتخابات کمرنگ باشد، مصالح ملی و امنیت و حیثیت مردم و نظام در جهان آسیب جدی خواهد دید.
وی به سخنانی از آیتالله خمینی در این خصوص که میزان رای ملت است استناد کرد و اظهار داشت این مردم بودند که جمهوری اسلامی را به این نقطه رسانده‌اند.
حسن روحانی همچنین با اشاره به مشارکت ۹۸ درصد مردم به رفراندوم جمهوری اسلامی، با ابراز تاسف از اینکه این مقدار اقبال به جمهوری اسلامی کم شده است، اظهار داشت مردم نباید فکر کنند حکومت بدون آنها می‌خواهد تصمیم بگیرد.
روحانی با بیان این موضوع که آیت الله خامنه‌ای همواره بر مشارکت حداکثری تاکید داشته است، اظهار داشت وی تصریح کرده است که مشارکت حداکثری مردم برای وی هدف اول است.
روحانی با بیان این اظهارات خاطرنشان کرد که وی به آیتالله خامنه‌ای نامه نوشته و از وی خواسته است که اگر می‌تواند درباره انتخابات کمک کنند، این کار را بکند. گرچه حسن روحانی عنوان کرده است که در نهایت این خود خامنه‌ای است که تصمیم خواهد گرفت که چه کند.
حسن روحانی همچنین گفته است که تنها کاری که دولت می‌توانسته است انجام دهد، تهیه همین نامه بوده است.
با توجه به حساسیت این دوره از انتخابات، علی خامنه‌ای با زیرکی تمام خود را از صحنه انتخابات کنار کشیده و تاکید کرده است که مداخله‌ای در انتخابات نخواهد داشت. در حالیکخ تمام امور را بیت رهبری هدایت میکرده است .
حتی برخی گمانه‌زنی‌های غیر رسمی حاکی از این است که قبل از انتشار رسمی کاندیداهای تاییدشده‌ی شورای نگهبان، برخی اعضای شورای نگهبان به بیت اعتراض کرده و خواستار مداخله‌ی وی در نحوه‌ی تایید صلاحیت‌ها شده است که وی موافقت نکرده و اعلام کرده مداخله‌ای در انتخابات نخواهد داشت. به گفته‌ی تحلیل‌گران آیت الله خامنه‌ای در سال ۸۸ با اعلام موضع صریح درباره کاندیدای ریاست جمهوری ۸۸، چنان بحرانی را در کشور ایجاد کرد و چنان خشمی که آتش آن تا ماه‌ها شعله ور بود و به خاک و خون کشیده شدن ده‌ها تن انجامید و شرایطی را در کشور ایجاد کرد که پس از آن دیگر نظام اجتماعی هرگز نتوانست به دوران قبل از ۸۸ باز گردد.
حسن روحانی در بخش دیگری از سخنان خود در جلسه هیات دولت همچنین با بیان این موضوع که رقابت جان انتخابات است، گفته است اگر این رقابت از آن گرفته شود، به یک انتخابات بی‌جان تبدیل می‌شود.
وی همچنین خاطرنشان کرد که دولت با همه توان باید انتخابات ریاست جمهوری را انجام دهد.
حسن روحانی در حالی نوشتن نامه به رهبری را تنها اقدام امکان‌پذیر برای دولت خود معرفی کرده است که وی همچنانکه خود را یک رئيس جمهور حداکثری و نماینده‌ی ملت می‌داند، باید که در سمت ملت و نه حاکمیت بایستد و به جای دفاع از نظام، از حقوق مردمی دفاع کند که او را بر سر کار آورده‌اند.
روحانی که دیگر چیزی برای از دست دادن ندارد، با خودداری از برگزاری این انتخابات یا برگزاری رفراندوم در مدت زمان باقیمانده از دولت وی، که اختیار هر دو کار را دارد، می‌تواند ثابت کند که یک رئیس جمهور مردمی است
