در ادامه‌ی واکنش‌ها به حمله به تاسیسات هسته‌ای نطنز، جهانگیری معاون اول رییس جمهور در لحنی بی سابقه به طور تلویحی به سازمان اطلاعات سپاه علیه کاهلی در نگهداری تاسیسات نطنز را مورد انتقاد قرار داد وبا تاکید بر اینکه یکی از اصلی ترین مسائل کشور این است که دستگاهی حاضر به پاسخگو بودن در یک مرجع دیگر نیست، خاطر نشان کرد گاهی هزینه های حیثیتی، اقتصادی و امنیتی عدم پاسخگویی افراد و دستگاها برای کشور فاجعه بار است.وی افزود باید بررسی شود دستگاهی که مسئول بوده جلوی اقدامات دشمن را بگیرد و در این زمینه توفیقی بدست نیاورده است بازخواست شود و مردم باید بدانند که منابع ، اعتبار و حیثیت کشور خرج چه اقداماتی می شود این به معنای ان است که اطلاعات سپاه علیرغم بودجه های میلیاردی حداقل در سه مورد هجوم واقع شده است که شامل ترور و انفجار بوده است و به هیچ کس نیز پاسخگو نیست .
همچنین محمد جواد ظریف در توییتی از نامه خود به دبیر کل سازمان ملل در مورد حمله اسراییل خبر داد که در ان گفته که هدف قراردادن تعمدی یکی از تاسیسات هسته‌ای تحت پادمان با خطر بالای نشت سراسری و بی‌هدف مواد رادیواکتیو یک تروریسم هسته ای و جنایت جنگی است.وی افزود اسرائیل در خصوص اقدام برای اجتناب از احیای برجام بعد از انتخابات ایالات متحده تهدید کرده بود و هم اکنون به رخ می کشد.واگر ایالات متحده خواهان جلوگیری از پیامدهای این قمار احمقانه است، باید از استفاده از تروریسم اقتصادی که از سوی ترامپ اجرا شد یا تروریسم هسته ای اخیر به عنوان اهرم مذاکراتی دست بکشد و تمامی تحریم های اعمال شده، مجددا اعمال شده و تغییر نام یافته از زمان اجرای برجام را لغو کند.ظریف در نامه خود تاکید کرده است پس از راستی آزمایی به موقع از لغو تمامی تحریم های ایالات متحده، ایران با توقف اقدامات جبرانی خود پاسخ خواهد داد؛ اقداماتی که هم اکنون به دلیل خرابکاری هسته ای اخیر به طور چشمگیری سیر صعودی به خود خواهد گرفت .ظریف اتهام جنایت جنگی به اسراییل وارد کرده است که ممکن است این روند حقوقی ادامه پیدا کند .
در این میان همچنین سعید خطیب زاده سخنگوی وزارت امور خارجه به تداوم برگزاری کمیسیون مشترک برجام در وین اشاره کرد و با بیان این موضوع که مذاکرات و گفت‌وگوها در چارچوب رفع تحریم‌های یکجانبه آمریکا دوباره از روز چهارشنبه آغاز خواهد شد، از سفر سرگئی لاوروف وزیر خارجه روسیه و نیز وزیر خارجه صربستان به ایران خبر داد. وی گفت حادثه نطنز می‌توانست فاجعه‌آفرین باشد، و این اتفاق می‌توانست به فاجعه‌ای محیط زیستی و انسانی تبدیل شود. وی در عین حال این اقدام اسرائیل را جنایت علیه بشریت خواند و اظهار داشت چنین جنایتی از ذات جنایتکارانه اسرائیل دور نیست. وی همچنین در مورد مذاکرات با امریکا گفت راستی آزمایی در خصوص رفع تحریم‌ها کار سختی نیست، خاطرنشان کرد اگر آمریکا بخواهد واقعا به اقدامات خودش برگردد، تمامی اقدامات و بسیاری از این مسائل قابل راستی آزمایی خواهد بود.
