علی مطهری در گفتوگویی ادعاهای عباسعلی کدخدایی، سخنگوی شورای نگهبان مبنی بر این که دلیل رد صلاحیت آقای مطهری موضوعات اقتصادی نبوده است بلکه دلایل دیگری مطرح بوده که از ایشان خواستیم اجازه دهند گفتوگوها با دوربین ثبت و ضبط شود، اما آقای مطهری اجازه ندادند را رد کرد و رد صلاحییت خود را در مورد بیان مواضعش در مورد روز نهم دی ماه ، زندانی شدن دکتر یزدی و حصر رهبران جنبش سبز دانست . وی گفت آقای کدخدایی پیشتر و در زمان انتخابات مجلس یازدهم نیز این مطالب را عیناً مطرح کرده بودند و من جواب ایشان را همان زمان دادم اما تعجب میکنم چرا دوباره این مطالب را بیان کردهاند.
مطهری گفت یکی از مطالبی که شورای نگهبان معتقد بود که نباید میگفتم این بود که در نطق خود در مجلس نهم گفته بودم نهم دی اگر موجب تفرقه شود دیگر یوم الله نیست بلکه یوم الشیطان است.و گفتند این خلاف نظر رهبری است. که میگوید گفتم اولاً خلاف نظر ایشان نیست. ثانیا من نظر خودم را گفتم.
وی افزود مورد بعدی سخنی بود که درباره زندانی شدن دکتر ابراهیم یزدی گفته بودم که ما با او برخورد خوبی نکردیم و به زندان انداختن آن پیرمرد کار درستی نبود. که شورای نگهبان میگفت این موضوع را نباید مطرح می کردید، چرا که برخورد با آقای یزدی موضع نظام بوده است موضوع دیگری که مطرح کردند مسئله رفع حصر خانگی بود. که چرا راجع به رفع حصر صحبت کردهای؟ باید می گفتی پس از اطلاع از نظر رهبری نظر من عوض شد.که میگوید من گفتم من نمیتوانم دروغ بگویم.
مطهری گفت پس از این گفتوگو، عضو حقوقدان شورای نگهبان را مورد عتاب قرار دادم و گفتم متأسفم که شما با چنین افکاری عضو شورای نگهبان هستید. حیف خون شهید مطهری که به زمین ریخت و من امروز این حرفها را از شما می شنوم. بعد بلند شدم و جلسه را ترک کردم.وی ادعاهای کدخدایی را در مورد می خواستند از جلسه فیلمبرداری کنند را به کلی نفی کرد و گفت اصلاً هیچ حرفی از این که فیلمبرداری انجام و گفتوگو ثبت و ضبط شود مطرح نبود. نمیدانم آقای کدخدایی این حرفها را از کجا آوردهاند.
شورای نگهبان در انتخابا ت اخر مجلس قمع و قلع اساسی از نمایندگان و کاندیداها انجام داد . که علی مطهری یکی از انها بود . برخلاف اظهارات کدخدایی بیان هرگونه اظهار نظری که با مواضع رهبر جمهوری اسلامی زاویه داشته باشد باعث رد صلاحییت کاندیداهای مجلس میشود که در اخرین آنها این رد صلاحیتها دامن سی درصد نمایندگان قبلی مجلس را گرفت .
