علی مطهری نماینده مردم تهران و نایب رییس مجلس در واکنش به اقدام مجمع در خصوص اصلاح یکی از مواد قانونی لایحه مبارزه با پولشویی، با استناد به توضیح روابط عمومی مجمع تشخیص مصلحت، اقدام مجمع را غیرقانونی خواند و با ابراز نگرانی از حضور عناصری در مجمع تشخیص که می‌خواهند با استفاده از فرصت بیماری آیت‌الله شاهرودی، مجمع را در جایگاه مجلس سنا قرار دهند، اظهار داشت چنین چیزی بدون تغییر قانون اساسی میسر نیست.
وی در این یادداشت اینستاگرامی خود، اقدام مجمع در تغییر مصوبه قانونی مجلس را غیرقانونی خواند و اظهار داشت مجمع بر اساس هیچکدام از اصول قانون اساسی، حق تغییر و یا اصلاح مصوبه مجلس را ندارد. وی تاکید کرد تنها وظیفه مجمع داوری بین نظر مجلس و شورای نگهبان است و مخیر است که یکی از دو نظر را انتخاب کند ولی حق ندارد که در مصوبه مجلس دخل و تصرفی انجام دهد. محسن رضایی، دبیر مجمع تشخیص مصلحت نظام با انتقاد از سخنان مطهری، گفته است تشبیه مجمع به مجلس سنا، تنزل جایگاه قانونی این نهاد است، اما واقعیت این است که با مداخلات اخیر مجمع در چارچوبی که مورد تایید قانون اساسی نیست، به واقع در تلاش است تا خارج از جایگاه قانونی، جایگاه متقاوتی را برای مجمع در نظام سیاسی ایران در نظر بگیرد.
چالش تصویب لوایح الحاق ایران به کنوانسیون مقابله با پولشویی همچنان ادامه دارد، و با وجودی که تعداد زیادی از نمایندگان در مجلس، و همچنین شمار قابل توجهی از اعضای مجمع تشخیص مصلحت نظام با تصویب الحاق ایران به کنوانسیون مقبله با تامین مالی تروریسم موافق هستند، برخی از افراد در مجلس و نیز مجمع تشخیص مصلحت نظام در تلاش هستند تا با دور زدن روند قانونی تصویب الحاق ایران به کنوانسیون، مانع از تصویب لایحه شوند. ظهارات محمدجواد ظریف و برخی دیگر از دولتمردان در خصوص منافع مالی گسترده ناشی از پولشویی برای مخالفان با تصویب این لایحه در ایران چالشی جدی در کشور ایجاد کرد و وزیر امور خارجه را تا پای استیضاح هم پیش برد.
