بدنبال وقوع حادثه مرگبار ناوچه کنارک که نزدیک به بیست نفر کشته شدند ، خامنه ای رهبر جمهوری اسلامی در پیامی که دو روز بعد از سانحه متشر کرد، ضمن ابراز تسلیت به عبدالرحیم موسوی، فرمانده کل ارتش و خانواده های پرسنل نیروی دریایی، حادثه شناور کنارک را بسیار تلخ و تاسف آور خواند وی گفت از مسئولان ذی ربط می خواهم که ابعاد این حادثه را به درستی روشن کرده، ضمن شناسایی مقصران احتمالی، تدابیر لازم برای عدم تکرار چنین پیشامد های خسارت بار و تلخ را اتخاذ کنند. این در حالی است که در سقوط هواپیمای اوکراینی چنین بیانیه ای صادر نکرد و خواستار تحققیق و مجازات عاملین ان نشد .
همزمان عبدالرحیم موسوی، فرمانده کل ارتش، روزسه شنبه در مراسم استقبال از پیکر کشته شدگان ناوچه کنارک گفت از نخستین لحظاتی که این اتفاق افتاد کار هایی که باید انجام می شد، انجام شد. که درحال حاضر چهار گروه کارشناسی از ستاد کل، وزارت دفاع، ارتش و نیروی دریایی در حال بررسی اتفاق هستند با این حال فرمانده کل ارتش به طور ضمنی بررسی و تحقیق درباره چگونگی سانحه رخ داده برای ناوچه کنارک را زمان بر عنوان کرد و گفت: معمولا در این گونه حوادث کار خیلی پیچیده است و اینکه معلوم شود چه بخشی مربوط به فناوری و چه بخشی مربوط به نیروی انسانی است، کار بسیار دقیقی را می طلبد.در این میان حسن روحانی رئیس جمهور با اشاره به حادثه‌ی شناور کنارک که به کشته شدن تعدادی از نیروی دریای ارتش در پی شلیک نیروهای خودی انجامید، با ابرار همدردی دولت نسبت به خاواده‌های جان‌باختگان اشاره کرد و از مسئولین خواست دلایل وقوع این حادثه برای مردم تشریح شود.
حسن روحانی در ادامه‌ی اظهاراتش بدون آنکه اشاره‌‌ی عمیقی به کشته شدن این افراد در اثر شلیک اشتباه توسط نیروهای خودی کند، و حتی بی‌انکه در این خصوص از مردم یا خانواده‌های جان‌باختگان عذرخواهی یا احساس شرمساری کند، به رزم در آب و جایگاه رزم در آب در روایات اسلامی اشاره کرد و اظهار داشت رزم و شهادت در آب دارای پاداشی ده برابر رزم در زمین است. وی در ادامه تنها به ابراز امیدواری در خصوص کاهش این حوادث در تمرینات نظامی و رزمایش‌ها اکتفا کرد و خواستار اعمال نظم شد تا از چنین حوادثی جلوگیری شود.
اینکه حسن روحانی حتی از ابراز یک عذرخواهی و شرمساری ساده به خاطر شلیک به شناور و کشته شدن نیروی دریایی ارتش توسط نیروهای خود خودداری کرده است، مورد انتقاد زیادی واقع شده است. گرچه بسیاری از تحلیل‌گران اظهار می‌دارند که این اولین بار نیست که حسن روحانی با این بهانه که اتفاقات در حیطه‌ی مستقیم مسئولیت وی نیستند حتی از عذرخواهی ساده هم در این خصوص دریغ می‌کند.
به گفته‌ی بسیاری از ناظران، کشته شدن افراد چه توسط نیروهای خودی و چه به قول مقام‌های جمهوری اسلامی، دشمنان، به یک امر عادی در جمهوری اسلامی تبدیل شده است و دیگر حتی تاثر آنها را نیز بر نمی‌انگیزد و مقام‌های جمهوری اسلامی دیگر حتی برای حفظ ظاهر نیز اقدام به ابراز همدردی و ابراز ناراحتی و شرمندگی در این خصوص نمی‌کنند.
