ارسال لایحه‌ی بودجه سال ۱۳۹۹، توسط دولت حسن روحانی به مجلس، همچون سال‌های گذشته، بحث‌ها و انتقادات زیادی به دنبال داشته است.
همچون سال‌های گذشته، بودجه‌ی نهادهایی که مصارف بودجه‌ی آنها زیر نظارت دولت قرار ندارد، از جمله نهاد رهبری، موسسات مذهبی و برخی از نهادهای فرهنگی و .. به شدت مورد انتقاد قرار گرفته و با مقایسه این بودجه‌ها با بودجه مناطق محروم، بودجه اختصاص‌یافته برای محرومیت‌زدایی، بودجه‌های عمرانی و پژوهشی و .. بر ناعادلانه بودن توزیع بودجه تاکید شده و همچون سال‌های گذاشته عملکرد دولت در تخصیص بودجه مورد انتقاد قرار گرفته است. در پی این مجادلات، محمدباقر نوبخت رئیس سازمان برنامه و بودجه نیز روز دوشنبه در نشست خبری که برای تشریح لایحه بودجه سال ۱۳۹۹ کل کشور برگزار شده بود، اظهار داشت هیچ‌کدام از اعداد بودجه مانند سال قبل نیست. نوبخت با اشاره به اینکه بودجه سال ۱۳۹۹ برای سومین سال تحریم بزرگ اقتصادی تهیه شده، نحوه‌ی وصول منابع در تحریم را نکته مهمی دانست و گفت برون‌داد این بودجه در زندگی روزمره مردم باید مشخص باشد
.این اظهارات نوبخت در حالی عنوان می‌شود که پیش از ارسال بودجه به مجلس، این اقدامات و من‌جمله نحوه‌ی وصول منابع باید توسط سازمان برنامه و بودجه برنامه‌ریزی و عملیاتی بشود و جزئیات آن من‌جمله نحوه وصول منابع و نیز پیش‌بینی مصارف به طور دقیق شناسایی و عملیاتی شده باشد. نوبخت در ادامه اظهاراتش با اشاره به اینکه مردم به دنبال این هستند تا بودجه در شرایط تنگنا گشایشی ایجاد کند، گفت بودجه باید منابع سال را براورد و مصارف را پیش‌بینی کند.
رئیس سازمان برنامه و بودجه، همچنبن رشد منابع عمومی را ۸ درصد دانست و با اشاره به اینکه این منابع از سه محل درامدها، واگذاری دارایی‌های سرمایه‌ای و مالی تامین می‌شود، گفت در بودجه ۹۹ مالیات‌ها ۲۶ درصد رشد داشته‌اند.
نوبخت همچنین پیش‌بینی میزان صادرات نفت در سال ۹۹ را یک میلیون بشکه دانست و گفت برای رفع مشکلات تحریم، مسیرهای جدیدی در دستور کار قرار گرفته است.
مساله‌ی تامین مالیات همواره یکی از چالش‌های جدی بودجه‌ای در دولت‌های جمهوری اسلامی است و دولت ها در تعیین میزان درامد مالیاتی همواره دچار خطا می‌شوند و با تامین منبع درامدی غیرواقعی در حوزه مالیاتی، عموما چالش‌های زیادی در بودجه در حوزه‌ی مالیات ایجاد می‌کنند.
در عین حال، در سال‌های اخیر که تحریم نفت ایران، یکی از چالش‌های جدی در اقتصاد وابسته‌ی نفتی جمهوری اسلامی است، بنا به گفته‌ی کارشناسان، پیش‌بینی فروش یک میلیون بشکه نفت در روز در سال ۹۹ در حالی که جمهوری اسلامی با وجود تلاش‌ها و رایزنی‌ها و نیز امتیازات تجاری متعدد برای شرکای تجاری خود، کمتر از ۵۰۰ هزار بشکه نفت و بنا به روایت‌هایی در حدود سیصد هزار بشکه نفت در روز به فروش می‌رساند، در نظر گرفتن عدد غیرواقعی فروش یک میلیون بشکه نفت در روز، بودجه سال آینده را چالش تامین منابع مواجه خواهد کرد.
